家犬和野生犬科动物的阐发性数据成本库(iDog)

2018年11月12日21:52:25家犬和野生犬科动物的阐发性数据成本库(iDog)已封锁评论 144 views

家犬和野生犬科动物的阐发性数据成本库(iDog)


AG平台女优iDog是家犬和野生犬的阐发性数据成本库,为全球狗研究范畴供给各类数据处事。 这包含基因,基因组,SNP,品种/疾病特征,基因表达,GO功能正文,狗 - 人类同源疾病和文献。 此外,iDog还供给用于施行基因组数据可视化和阐发的在线东西。

AG平台女优iDog由中国科学院北京基因组研究所(BIG)的BIG数据核心斥地和维护。 大部门数据来自中国科学院昆明动物研究所(KIZ)遗传成本与进化国度重点测验测验室。

根底动静

网站名称 家犬和野生犬科动物的阐发性数据成本库(iDog)
成本类型 特色数据
网站分类 科学数据
国度地域 中国
收录时间 2018-11-12
网站地址

详尽引见


家犬和野生犬科动物的阐发性数据成本库(iDog)2018年11月,由北京基因组所与昆明动物所合作斥地的犬科动物数据库iDog正式上线。该项研究功能以“iDog:an integrated resource for domestic dogs and wild animals”为题在国际学术期刊Nucleic Acids ResearchAG平台女优在线颁布。iDog是第一个勤恳于家犬(Canis lupus familiaris)和野生犬科动物的阐发性数据成本库,为全世界措置犬科研究的科研人员供给各类数据处事和在线阐发东西。

家犬是天然界中种内遗传多样性最为丰厚的物种之一,也是良多人类遗传病的根柢研究模子。近年来,跟着基因组学手艺成长,越来越多犬种的基因组被解析,犬类基因、SNP、品种、疾病、基因表达等生物数据也被大量发布,但尚未有供给犬类完整数据处事的数据库,为该类研究带来不便。

北京基因组研究所连系昆明动物所合作斥地iDog数据库系统,整合丰厚的犬科多组学数据,供给统一的数据共享处事。同时,还整合了序列比对东西用于线上数据阐发以及基因组浏览器用于数据可视化解析。iDog的成立不只无益于全球范畴内犬科动物的研究,同时还为大量的爱狗人士供给了一个用户敌对的界面查找相关宠物狗动静。

iDog具有优良的可拓展性和持续性,次要包含基于127个家犬样本基因组重测序数据发生的变异动静数据库、含有32220个基因的犬科动物基因数据库、基于RNA-Seq测序数据的基因表达数据库、犬科动物相关疾病的文献数据库、人-狗疾病同源动静数据库、犬科动物基因组拼接数据库等。iDog将在持续整合更多的组学数据,在Dog10K项方针布景下,更新高质量的数据集,逐步转化成犬科动物根柢研究的动静学问宝库。

 

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附加材料


 

参考材料


 

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