生命与健康大数据核心(BIGD)

2018年11月12日21:27:34生命与健康大数据核心(BIGD)已封锁评论 182 views

生命与健康大数据核心


生命与健康大数据核心(BIG DataCenter;简称BIGD)是研究所科研、支撑系统的一部门,其成长方针为面向我国人丁健康和社会可持续成长的严峻策略需求,环抱国度精准医学和次要策略生物成本的组学数据,成立海量生物组学大数据储存、整合与挖掘阐发研究系统,成长组学大数据系统成立、挖掘与阐发的新手艺、新编制,拔擢组学大数据汇交、把持与共享平台,力争建成支撑我国生命科学成长、国际出名的生命与健康大数据核心。

生命与健康大数据核心目前具有30余人的工作团队,具备5000个以上CPU算计核心及总容量逾越8PB数据存储成本,已经斥地构成一系列的多组学数据库系统,BIGD的次要勤恳于以下三方面的工作:

  • 环抱中国人群普惠健康的精准医学相关组学动静成本,美满成立中国人群基因组遗传变异图谱,构成中国人群精准医学动静库
  • 基于高通量测序的海量原始组学数据成本,成立合适国际标准的原始组学数据归档库,构成中国原始组学数据的共享平台
  • 环抱国度次要策略生物成本,成立海量组学数据的整合、挖掘与把持系统,构成阐发性的多组学数据库系统。

根底动静

网站名称 生命与健康大数据核心
成本类型 特色数据
网站分类 科学数据
国度地域 中国
收录时间 2018-11-12
网站地址

详尽引见


生命与健康大数据核心(BIGD)生命与健康大数据核心的定位与方针是,面向我国人丁健康和社会可持续成长的严峻策略需求,环抱国度精准医学和次要策略生物成本的组学数据,成立海量生物组学大数据储存、整合与挖掘阐发研究系统,成长组学大数据系统成立、挖掘与阐发的新手艺、新编制,拔擢组学大数据汇交、把持与共享平台。核心次要涵盖以下三个部门:

原始组学数据部门 Branch of Genome Sequence Archive (GSA)

  • 存储多种高通量测序的海量原始组学数据成本
  • 成立合适国际标准的原始组学数据归档库
  • 构成中国原始组学数据的共享平台

精准医学组学数据部门 Branch of Precision Medicine Omics Databank (PMOD)

  • 整合公共小我组学数据,成立不合人群的基因组参考序列
  • 美满成立中国人群基因组遗传变异图谱
  • 构成中国人群精准医学动静库,为疾病的诊疗供给更为无效的编制

次要动动物组学数据部门 Branch of Animal & Plant Omics Databank (APOD)

  • 环抱国度次要策略生物成本
  • 成立海量组学数据的整合、挖掘与把持系统
  • 构成阐发性的多组学数据库系统

此外,还有特地的动静系统打点部门给以手艺和处事支撑

动静系统打点部门 Branch of Information & System Management (ISM)

  • 担任收集以及系统根柢设备的打点
  • 打点和维护机房处事器,供给平安靠得住的Web系统。
  • 与其他部门协调,确保BIGD所有成本都不竭平安靠得住。

生命与健康大数据核心(BIGD)

研究内容

生命与健康大数据核心(BIGD)的研究侧重于算计生物学和生物动静学中的根底科学问题,方针是将大型组学数据转换成严峻发觉。BIGD具有包含生物动静学,分子生物学,算计机科学和数学等多学科的专家和科研人员。BIGD研究人员勤恳于海量数据的整合,斥地前辈的算法东西,从大数据中挖掘宝藏。

研究内容次要集中在以下几个方面:(1)基于高通量测序的海量原始组学数据成本,成立合适国际标准的组学原始数据归档库,构成中国组学原始数据共享平台;(2)环抱中国人群普惠健康的精准医学相关组学动静成本,成立中国人群基因组遗传变异图谱,构成中国人群精准医学动静库;(3)环抱中国人群普惠健康的精准医学相关组学动静成本,成立中国人群基因组遗传变异图谱,构成中国人群精准医学动静库。

根柢设备

生命与健康大数据核心不竭加强高机能算计与存储能力拔擢,截至2017岁尾,具有150万亿次/秒的算计能力,约6800个算计核心,12PB的存储成本,1.5Gbps收集带宽,构成了国内领先的生物大数据云算计平台。支撑国度重点研发筹算、国度天然科学基金、中科院策略先导专项等60余个科研项目,为院表里16家科研单元的79个课题组供给数据储存与算计处事,平均每天活跃用户逾越600人次。

合作项目

DogSD

  • 中国科学院昆明动物研究所

IC4R

  • 河南农业大学
  • 华中科技大学
  • 华中农业大学
  • 内蒙古师范大学
  • 北京大学

LncRNAWiki

  • 沙特阿卜杜拉国王科技大学

RiceWiki

  • 北京理工大学
  • 华中农业大学

SorgSD

  • 中国科学院动物研究所

 

生命与健康大数据核心(BIGD)

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附加材料


 

参考材料


 

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